Botanicky patří park k nejcennějším lokalitám Balkánu. Rostou zde různé endemity a také třetihorní relikty (kavyly, ramodie). Pozoruhodná je pestrá paleta zdejších dřevin, kterých zde napočítali 186 druhů, včetně takových vzácností jako je břestovec kavkazský. Hory jsou porostlé listnatými lesy s buky, habry a granátovými jablky, houštinami kosodřeviny a ve vyšších polohách převládají subalpínské a alpínské louky, využívané jako pastviny. Ze zvířat zde žijí velké šelmy - medvěd, vlk a balkánská forma rysa ostrovida o jehož přežití se ochránci přírody snaží. Hojní jsou netopýři a vápenci. Najdeme zde přes 1.650 druhů motýlů a množství ptačích druhů. Od dravců (dřemlík tundrový, orel skalní, supi) po vodní ptactvo při březích obou jezer (pelikáni, kormoráni). Z památek stojí za návštěvu starobylé město Ohrid s osídlením ilyrským, řeckým i římským a klášter sv. Nauma z 10.století na břehu Ohridského jezera.
Obě velká jezera – Ohridské a Prespanské jsou sice oddělena horským masivem, ale jde o spojité nádoby. Z menšího a výše položeného Prespanského jezera (na povrchu je bezodtoké) teče podzemní řeka přes krasové dutiny v podzemí až do Ohridského jezera. A z něj potom vytéká voda řekou Crni Drin do Jaderského moře. Obě jezera mají křišťálově čistou vodu, v létě až 240 C teplou.